Ist doch ganz einfach:
Du schaust erstmal ins Handbuch vom Mainboard welcher Anschluss für den Cardreader war. Der hat eine Bezeichnung. Falls kein Handbuch zur Hand, PDF vom Hersteller runterladen und dann dort nachlesen. Dort steht auch ziehmlich genau beschrieben wo diese Option im Bios vorhanden ist, und dann einfach "Disable" oder "Deaktivieren" oder was auch immer dort steht. Jedenfalls wirst du ohne Handbuch nicht sehr weit kommen, und selber machen musst du das auch

Viel Erfolg
Mfg.