So wie ich das sehe ist die Partitionstabelle hauptsächlich dazu da, partitionen und Dateisysteme festzulegen. Mag sein das da definitionsgemäß noch mehr dazugehört, aber der Teil, der Partitionen festlegt, und der teil, der das Booten regelt sind zumindest weitgehend voneinander unabhängig. wenn du fixmbr eintippst, dann wird die Partitionstabelle nicht geändert, sonst wären nämlich mit ziemlicher wahrscheinlichkeit mindestens eine, wenn nicht mehrere Partitionen am arsch.
Allerdings stehen die Boot-Flags in der Partitionstabelle, und probleme mit dem Booten bei meinem zweitrechner ließen sich auch durch eine gewissen verwurschtelung von Partitionstabelle und MBR erklären...
Edit:
http://de.wikipedia.org/wiki/MBR - ist sogar eher so das die Partitionstabelle zum MBR gehört.